9月12日0—24時，31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增確診病例49例。其中境外輸入病例27例（云南17例，上海5例，廣東3例，四川1例，陜西1例），含1例由無癥狀感染者轉為確診病例（在四川）；本土病例22例（均在福建，其中莆田市15例、泉州市6例、廈門市1例），含2例由無癥狀感染者轉為確診病例（均在福建）。無新增死亡病例。無新增疑似病例。
當日新增治愈出院病例38例，解除醫學觀察的密切接觸者639人，重癥病例較前一日減少1例。
境外輸入現有確診病例597例（其中重癥病例6例），現有疑似病例3例（核增1例）。累計確診病例8645例，累計治愈出院病例8048例，無死亡病例。
截至9月12日24時，據31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例751例（其中重癥病例6例），累計治愈出院病例89861例，累計死亡病例4636例，累計報告確診病例95248例，現有疑似病例3例（核增1例）。累計追蹤到密切接觸者1171158人，尚在醫學觀察的密切接觸者12320人。
31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者28例，其中境外輸入15例，本土13例（均在福建莆田市）；當日轉為確診病例3例（境外輸入1例）；當日解除醫學觀察10例（境外輸入8例）；尚在醫學觀察的無癥狀感染者411例（境外輸入359例）。
累計收到港澳臺地區通報確診病例28296例。其中，香港特別行政區12145例（出院11846例，死亡212例），澳門特別行政區63例（出院63例），臺灣地區16088例（出院13742例，死亡839例）。
